試劑準備區 儀器設備主要有冰箱、超凈臺、加樣器、混勻器、天平和離心機等，加樣器、天平除了要專用外，還應有定期校準。 試劑分裝應在超凈臺中進行 擴增反應混合液應使用分子生物學級的，試劑制備好后應有質檢：一是否有污染、二是檢測試劑的擴增效果。 標本制備區 儀器設備主要有生物安全柜、加樣器、離心機、溫育儀、混勻器等
擴增區 擴增區的主要儀器是核酸擴增儀、超凈臺、微量加樣器、離心機、可移動紫外燈。擴增儀需進行校準。并配備UPS電源，以防止由于電壓的波動，停電對擴增效果的影響。 分析區 本區所使用的儀器設備有酶標儀、洗板機、加樣器和水浴箱等。
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