無菌、已知菌以及無特殊病原體動物都需要在無菌或盡可能無菌的環境里飼養，這種環境，目前國際上通用稱為屏障環境，即用一道屏障把動物與周圍污染的環境隔開，就如胎鼠在母鼠子宮內一樣。這種環境從控制微生物的角度分為隔離系統、屏障系統、半屏障系統、開放系統和層流架系統等五大類。
SPF動物實驗室的無菌室設計：A隔離系統
是在帶有操作手套的容器中飼養動物的系統，用于飼養無菌動物和棲生動物。內部保持按微生物要求的100級的潔凈度，但其設置的房間及操作人員不必按無菌室考慮。
B屏障系統
把10000~100000級左右的無菌潔凈室作為飼養室，主要用于無特殊病原體動物的長期飼養和繁殖。入室施行嚴格管理，如淋浴、換貼身衣服等。
C半屏障系統 放寬對屏障系統中人及物出入房間時的管理，平面組成大致與屏障系統相同。
D層流架系統 籠具放在潔凈的水平層流空氣中。常用于小規模飼養，但在一般房間進行飼養、操作和處理時有被污染的危險性?？捎糜诎肫琳系难a充。
E開放系統 是對人、物、空氣等進出房間均不施行消除污染的系統，但通常要進行某種程度的清潔管理。
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